MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 97259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014328	AATG	2	8	100	107	50 %	25 %	25 %	0 %	300853233
2	NC_014328	ATA	2	6	143	148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853233
3	NC_014328	ATTA	2	8	304	311	50 %	50 %	0 %	0 %	300853233
4	NC_014328	A	7	7	316	322	100 %	0 %	0 %	0 %	300853233
5	NC_014328	ACA	2	6	324	329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853233
6	NC_014328	AGA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853233
7	NC_014328	TAA	2	6	382	387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853233
8	NC_014328	ATG	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853233
9	NC_014328	GTAATA	2	12	474	485	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	300853233
10	NC_014328	ATGC	2	8	587	594	25 %	25 %	25 %	25 %	300853233
11	NC_014328	AAT	2	6	617	622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853233
12	NC_014328	AGT	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853233
13	NC_014328	GAT	2	6	689	694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853233
14	NC_014328	AAAT	2	8	712	719	75 %	25 %	0 %	0 %	300853233
15	NC_014328	GAT	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853233
16	NC_014328	AAAG	2	8	770	777	75 %	0 %	25 %	0 %	300853233
17	NC_014328	T	6	6	791	796	0 %	100 %	0 %	0 %	300853233
18	NC_014328	TAA	2	6	823	828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853233
19	NC_014328	TCTA	2	8	838	845	25 %	50 %	0 %	25 %	300853233
20	NC_014328	ACC	2	6	853	858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300853233
21	NC_014328	AGA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853233
22	NC_014328	ACC	2	6	928	933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300853233
23	NC_014328	A	6	6	961	966	100 %	0 %	0 %	0 %	300853233
24	NC_014328	TA	3	6	1013	1018	50 %	50 %	0 %	0 %	300853233
25	NC_014328	CTA	2	6	1020	1025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853233
26	NC_014328	TAA	2	6	1062	1067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853233
27	NC_014328	TAT	2	6	1202	1207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853233
28	NC_014328	GAT	2	6	1220	1225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853233
29	NC_014328	AAG	2	6	1237	1242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853233
30	NC_014328	GAA	2	6	1325	1330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853233
31	NC_014328	TAC	2	6	1348	1353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853233
32	NC_014328	A	6	6	1371	1376	100 %	0 %	0 %	0 %	300853233
33	NC_014328	AAG	2	6	1741	1746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
34	NC_014328	TTA	2	6	1810	1815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853234
35	NC_014328	AAATT	2	10	1831	1840	60 %	40 %	0 %	0 %	300853234
36	NC_014328	AAAT	2	8	1876	1883	75 %	25 %	0 %	0 %	300853234
37	NC_014328	AGA	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
38	NC_014328	GTA	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853234
39	NC_014328	CTA	2	6	1975	1980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853234
40	NC_014328	AAT	2	6	1986	1991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
41	NC_014328	ATA	2	6	2001	2006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
42	NC_014328	AGA	2	6	2045	2050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
43	NC_014328	ATT	2	6	2082	2087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853234
44	NC_014328	A	6	6	2101	2106	100 %	0 %	0 %	0 %	300853234
45	NC_014328	TGC	2	6	2138	2143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853234
46	NC_014328	A	6	6	2199	2204	100 %	0 %	0 %	0 %	300853234
47	NC_014328	TAG	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853234
48	NC_014328	ATA	2	6	2271	2276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
49	NC_014328	A	6	6	2293	2298	100 %	0 %	0 %	0 %	300853234
50	NC_014328	AGA	2	6	2324	2329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
51	NC_014328	ATA	2	6	2386	2391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
52	NC_014328	AATTT	2	10	2455	2464	40 %	60 %	0 %	0 %	300853234
53	NC_014328	AGA	2	6	2483	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
54	NC_014328	TAA	2	6	2545	2550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
55	NC_014328	AGA	2	6	2561	2566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
56	NC_014328	ACA	2	6	2569	2574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853234
57	NC_014328	ATA	2	6	2577	2582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
58	NC_014328	AGA	2	6	2612	2617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
59	NC_014328	ATT	2	6	2627	2632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853234
60	NC_014328	AC	3	6	2641	2646	50 %	0 %	0 %	50 %	300853234
61	NC_014328	AAT	2	6	2690	2695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
62	NC_014328	GAA	3	9	2700	2708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
63	NC_014328	AGC	2	6	2727	2732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853234
64	NC_014328	TAAAAA	2	12	2811	2822	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	300853234
65	NC_014328	ATGA	2	8	2841	2848	50 %	25 %	25 %	0 %	300853235
66	NC_014328	AATTAA	2	12	2849	2860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853235
67	NC_014328	TAA	2	6	2869	2874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853235
68	NC_014328	GGTAAA	2	12	2951	2962	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	300853235
69	NC_014328	GAA	2	6	2986	2991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853235
70	NC_014328	A	6	6	3025	3030	100 %	0 %	0 %	0 %	300853235
71	NC_014328	TA	3	6	3041	3046	50 %	50 %	0 %	0 %	300853235
72	NC_014328	TTA	2	6	3139	3144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853236
73	NC_014328	AT	3	6	3229	3234	50 %	50 %	0 %	0 %	300853236
74	NC_014328	AG	3	6	3236	3241	50 %	0 %	50 %	0 %	300853236
75	NC_014328	TA	3	6	3242	3247	50 %	50 %	0 %	0 %	300853236
76	NC_014328	ATAAGG	2	12	3280	3291	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	300853236
77	NC_014328	TAA	2	6	3295	3300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853236
78	NC_014328	TA	3	6	3321	3326	50 %	50 %	0 %	0 %	300853236
79	NC_014328	TA	3	6	3337	3342	50 %	50 %	0 %	0 %	300853236
80	NC_014328	TCA	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853236
81	NC_014328	CA	3	6	3349	3354	50 %	0 %	0 %	50 %	300853236
82	NC_014328	A	7	7	3366	3372	100 %	0 %	0 %	0 %	300853236
83	NC_014328	AAG	2	6	3391	3396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853236
84	NC_014328	TAAA	2	8	3430	3437	75 %	25 %	0 %	0 %	300853236
85	NC_014328	GTA	2	6	3465	3470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853236
86	NC_014328	AGA	2	6	3482	3487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853236
87	NC_014328	ATA	2	6	3495	3500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853236
88	NC_014328	CTT	2	6	3511	3516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853236
89	NC_014328	AGA	2	6	3519	3524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853236
90	NC_014328	ATT	2	6	3565	3570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853236
91	NC_014328	GAAA	2	8	3603	3610	75 %	0 %	25 %	0 %	300853236
92	NC_014328	TTA	2	6	3612	3617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853236
93	NC_014328	AT	4	8	3655	3662	50 %	50 %	0 %	0 %	300853236
94	NC_014328	AAAT	2	8	3707	3714	75 %	25 %	0 %	0 %	300853236
95	NC_014328	AAAC	2	8	3719	3726	75 %	0 %	0 %	25 %	300853236
96	NC_014328	ATT	2	6	3744	3749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853236
97	NC_014328	A	6	6	3775	3780	100 %	0 %	0 %	0 %	300853236
98	NC_014328	ATA	2	6	3817	3822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853236
99	NC_014328	GAT	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853236
100	NC_014328	ACA	2	6	3962	3967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853236
101	NC_014328	ATA	2	6	4008	4013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853236
102	NC_014328	TTA	2	6	4041	4046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853236
103	NC_014328	GAT	2	6	4050	4055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853236
104	NC_014328	TA	3	6	4089	4094	50 %	50 %	0 %	0 %	300853236
105	NC_014328	A	8	8	4152	4159	100 %	0 %	0 %	0 %	300853236
106	NC_014328	A	7	7	4163	4169	100 %	0 %	0 %	0 %	300853236
107	NC_014328	AATTT	2	10	4211	4220	40 %	60 %	0 %	0 %	300853236
108	NC_014328	GTT	2	6	4263	4268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853237
109	NC_014328	GAA	2	6	4350	4355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853237
110	NC_014328	A	6	6	4369	4374	100 %	0 %	0 %	0 %	300853237
111	NC_014328	TCAT	2	8	4395	4402	25 %	50 %	0 %	25 %	300853237
112	NC_014328	TAAA	2	8	4414	4421	75 %	25 %	0 %	0 %	300853237
113	NC_014328	A	7	7	4419	4425	100 %	0 %	0 %	0 %	300853237
114	NC_014328	ATTT	2	8	4431	4438	25 %	75 %	0 %	0 %	300853237
115	NC_014328	ATG	2	6	4517	4522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
116	NC_014328	A	7	7	4527	4533	100 %	0 %	0 %	0 %	300853238
117	NC_014328	ATG	2	6	4542	4547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
118	NC_014328	TCA	2	6	4633	4638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853238
119	NC_014328	ATA	2	6	4659	4664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853238
120	NC_014328	ATAAA	2	10	4695	4704	80 %	20 %	0 %	0 %	300853238
121	NC_014328	GAA	2	6	4783	4788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853238
122	NC_014328	TAC	2	6	4815	4820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853238
123	NC_014328	AGG	2	6	4825	4830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853238
124	NC_014328	TGG	3	9	4837	4845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853238
125	NC_014328	CGG	2	6	4861	4866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300853238
126	NC_014328	TGAAGT	2	12	4915	4926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
127	NC_014328	AT	3	6	4941	4946	50 %	50 %	0 %	0 %	300853238
128	NC_014328	ATA	2	6	4991	4996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853238
129	NC_014328	GAG	2	6	5006	5011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853238
130	NC_014328	TGA	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
131	NC_014328	AGA	2	6	5137	5142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853238
132	NC_014328	GA	4	8	5144	5151	50 %	0 %	50 %	0 %	300853238
133	NC_014328	AGA	2	6	5158	5163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853238
134	NC_014328	AAC	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853238
135	NC_014328	TA	3	6	5242	5247	50 %	50 %	0 %	0 %	300853238
136	NC_014328	A	6	6	5258	5263	100 %	0 %	0 %	0 %	300853238
137	NC_014328	ACT	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853238
138	NC_014328	ATG	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
139	NC_014328	TAA	2	6	5332	5337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853238
140	NC_014328	A	7	7	5413	5419	100 %	0 %	0 %	0 %	300853238
141	NC_014328	AAAAC	2	10	5531	5540	80 %	0 %	0 %	20 %	300853238
142	NC_014328	T	6	6	5599	5604	0 %	100 %	0 %	0 %	300853238
143	NC_014328	GAT	2	6	5629	5634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
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145	NC_014328	AT	3	6	5780	5785	50 %	50 %	0 %	0 %	300853238
146	NC_014328	TAGAAA	2	12	5827	5838	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	300853238
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148	NC_014328	GAA	2	6	5915	5920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853238
149	NC_014328	TAAA	2	8	5973	5980	75 %	25 %	0 %	0 %	300853238
150	NC_014328	AATAA	2	10	5990	5999	80 %	20 %	0 %	0 %	300853238
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154	NC_014328	ACTT	2	8	6049	6056	25 %	50 %	0 %	25 %	300853238
155	NC_014328	T	6	6	6055	6060	0 %	100 %	0 %	0 %	300853238
156	NC_014328	AT	3	6	6067	6072	50 %	50 %	0 %	0 %	300853238
157	NC_014328	TTG	2	6	6081	6086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853238
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161	NC_014328	GAA	2	6	6139	6144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853238
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164	NC_014328	TAC	2	6	6271	6276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853238
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171	NC_014328	TA	3	6	6505	6510	50 %	50 %	0 %	0 %	300853239
172	NC_014328	AGA	2	6	6580	6585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
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255	NC_014328	TAA	2	6	15865	15870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853242
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261	NC_014328	T	8	8	16072	16079	0 %	100 %	0 %	0 %	300853242
262	NC_014328	T	6	6	16097	16102	0 %	100 %	0 %	0 %	300853242
263	NC_014328	CTT	2	6	16105	16110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853242
264	NC_014328	CAA	2	6	16169	16174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853242
265	NC_014328	A	6	6	16173	16178	100 %	0 %	0 %	0 %	300853242
266	NC_014328	TA	3	6	16209	16214	50 %	50 %	0 %	0 %	300853242
267	NC_014328	TTAT	2	8	16260	16267	25 %	75 %	0 %	0 %	300853242
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269	NC_014328	AT	3	6	16363	16368	50 %	50 %	0 %	0 %	300853242
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302	NC_014328	TA	3	6	17610	17615	50 %	50 %	0 %	0 %	300853242
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